如果有以下情況出現，當事人是不能通過民政機關辦理協議的：
1.一方要求離婚的。也就是說，一方要求離婚，另一方不同意的，要求離婚的當事人只能向法院起訴要求離婚。
2.雙方要求離婚，但是對、夫妻一方生活困難的經濟幫助、財產及債務處理等事項未達成協議的，當事人只能通過法院解除婚姻關系。雖然雙方都同意離婚，但是對于、子女撫養等分歧不能達成一致意見的，也不能到民政局辦理協議離婚手續，而只能通過法院解決雙方的爭議，從而以訴訟手段解除雙方的婚姻關系。
3.一方或者雙方當事人為限制民事行為能力或者無民事行為能力的。如果一方為精神病患者，被醫院確診為無民事行為能力，民政局是不可以受理離婚申請的，因為民政局不能確定當事人是否具備真實自愿的離婚意愿。同樣，法院也不會直接受理被確定為無民事行為能力的當事人的離婚起訴，只能由另一方當事人起訴。若當事人被醫學鑒定為無民事行為能力人的，包括當事人親屬在內的任何其他人都不能代替當事人起訴離婚。如果對方當事人是無民事行為能力人，當事人可以向法院提起離婚訴訟，而由對方當事人的法定人作為對方當事人的代理人參加訴訟。
4.未辦理的。如果當事人是事實婚姻或同居關系，根本沒有辦理結婚登記，如果現在鬧離婚，只能到法院辦理離婚手續，民政局不予辦理。根據現行的法律規定，符合結婚實質要件的當事人雙方是在1994年2月1日以前，雖然未登記結婚，但是以夫妻名義在一起同居生活的，構成事實婚姻。但如果現在解除事實婚姻關系，只能到法院辦理離婚手續;1994年2月1日以后，男女雙方在一起生活，只是同居關系，可以自行解除，不需要到民政局或法院辦理解除關系手續，只是雙方有財產或子女撫養糾紛，才可直接向法院起訴。 5.雙方是在國外登記結婚的。隨著時代的發展，越來越多的中國人和外國人結婚，是在外國登記的，或是在港、澳、臺注冊的，對于不在中國大陸登記的婚姻，當事人要解除，不管雙方是否能夠達成協議，只能通過人民法院以訴訟方式離婚。
