目前，房屋租賃管理部門根據相關法規和稅務部門的委托，對房屋租賃征收租賃管理費，代征私人房屋租賃稅和外地駐深企業房屋租賃稅。租賃管理費和房屋租賃稅都是以租金為基礎，按照一定的標準組織征收。
1、房屋租金收入的認定
(1)房屋租金收入的認定原則
房屋租金收入的認定是房屋租賃稅費計征的核心問題。房屋租金收入的認定主要有兩個原則：一是合同租金與指導租金孰高原則，二是核定租金原則。
①合同租金與指導租金孰高原則
《深圳經濟特區房屋租賃條例》第十五條規定：“稅務部門和區主管機關征收有關稅金或者收取房屋租賃管理費時，以指導租金作為計算基數;租賃合同約定的租金高于指導租金時，以合同約定的租金為計算基數”。
②核定租金收入原則
以寶安區為例，《寶安區私人房屋租賃稅費征收管理暫行辦法》把寶安區私人房屋分為居民自建房和居民非自建房、集資房三類進行分類管理。居民非自建房、集資房采用合同租金與指導租金孰高原則確定租金收入。除對需要按實際租金收入開具發票的居民自建出租房按合同租金與指導租金孰高原則確定租金收入外，其它居民自建房采用核定方式確定租金收入。這種采用核定方式認定的租金稱為核定租金。
(2)居民自建房租金收入核定的方法和程序
①核定租金收入的計算公式
核定租金收入=住宅租金收入+商業租金收入
住宅租金收入=可出租住宅面積×住宅指導租金×住宅出租率
商業租金收入=商鋪面積×商業指導租金×商鋪出租率
可出租住宅面積=(整棟房屋層數—業主自用層數)×每層平均建筑面積
商鋪面積=商鋪租賃雙方合同約定實際面積
該房屋所屬區域已出租房屋面積
出租率= ×100%
該房屋所屬區域可出租房屋面積
居民自建房建筑面積是征收稅費的計算依據。居民自建房稅費征收以棟為單位計算總建筑面積。如房地產權利證書或者有效材料表明同一棟樓房的合法所有權或使用權分屬兩位或兩位以上業主的，可對業主分別計算總建筑面積。
住宅指導租金和商業指導租金為市租賃管理辦每年度公布的房屋租賃指導租金，特殊情況下也可采用租賃管理所上報區、市租賃管理辦批準的指導租金。
住宅出租率和商鋪出租率為該房屋所屬區域的已出租房屋面積占可出租房屋面積的比例。
應繳房屋租賃管理費=核定租金收入×租賃管理費率
②核定租金收入的方法和程序
a、申報登記。凡是本轄區范圍內的居民自建房屋，無論出租與否，一律如實登記，納入管理的范圍。
b、核定出租率。每年初，由租賃管理所和稅務所組織成立聯合審定小組，在分片選點的基礎上，對各片區房屋出租情況進行典型調查，審核確定出租比率，并以報表形式報區租賃管理辦和區地稅局備案。
c、核實出租面積。由代征人員實地察看自建房總層數、業主自用層數和每層平均建筑面積及商鋪面積，登記《私人出租屋稅費核定審批表》，由租賃管理站初審核實各棟樓可出租房屋總建筑面積后，上報租賃管理所審定。
d、確定租賃面積、計算租金收入。租賃管理所收集整理管理站上報的《私人出租屋稅費核定審批表》，計算填寫租金收入等相關內容。核定租金的有關情況以報表形式報區租賃管理辦和稅務所備案。稅務所若有異議，應及時進行調查核實，并將修改意見回復租賃管理所，由租賃管理所重新核定租金收入。
e、文書送達。租賃管理所根據審核通過的《私人出租屋稅費核定審批表》，制作《私人房屋租賃繳納稅費登記卡》發還管理站，由管理員送達業主。業主按《私人房屋租賃繳納稅費登記卡》的內容到所屬管理站(所)繳納稅費。
f、租金調整。業主如對核定的租金收入有異議，可在收到《私人房屋租賃繳納稅費登記卡》的5日內，向租賃管理所提出復核書面申請。租賃管理所應及時給予答復。對不予調整的進行解釋說明;對需要調整的及時組織復核、重新核定，并收回原送達的《私人房屋租賃繳納稅費登記卡》作廢。
g、檢查復核。每年由區地方稅務局和區房屋租賃管理辦公室抽調人員組成聯合檢查復核小組，采取不定期方式，對年內各租賃管理所核定租金情況進行檢查復核，檢查結果在兩個系統內進行通報。
h、申報停租或變更。對已實行“核定租金”方式管理的出租屋，原則上不再受理停租或變更。特殊情況下需要申報停租或變更的，業主必須提出書面申請，報管理站、租賃管理所、區租賃管理辦逐級調查核實后，以報表形式向稅務機關備案。
2、房屋租賃管理費征收管理
(1)房屋租賃管理費的概念
房屋租賃管理費是房屋租賃管理部門依法對房屋租賃行為征收的一種行政性收費。房屋租賃管理費的概念有以下涵義：
①房屋租賃管理費是一種行政性收費;
②房屋租賃管理費征收主體是房屋租賃管理部門 ;
④房屋租賃管理費的征收對象是房屋租賃行為;
⑤房屋租賃管理費交納人是房屋收益人，包括出租人和轉租人等。
(2)房屋租賃管理費征收標準和依據
房屋租賃管理費征收標準
根據《深圳經濟特區房屋租賃條例》第十三條規定：
①出租房屋辦理房屋租賃合同登記的，出租人應當按月租金的百分之二，向區主管機關繳納房屋租賃管理費。
②出租房屋辦理備案手續的，出租人應當按月租金的百分之三向區主管機關繳納房屋租賃管理費。
③房屋轉租的，轉租租金高于原租金的差額部分，應當按上述規定的標準，由轉租人繳納房屋租賃管理費。
房屋租賃管理費計費依據
房屋租賃管理費計費依據是房屋租金，租金收入按下列規定認定：
①根據《深圳經濟特區房屋租賃條例》第十五條的規定，區主管機關征收有關稅金或者收取房屋租賃管理費時，以指導租金作為計算基數;租賃合同約定的租金高于指導租金時，以合同約定的租金為計算基數。
②根據《寶安區私人房屋租賃稅費征收管理暫行辦法》規定，一般情況下，居民自建房出租屋以核定租金收入為依據計征租賃管理費。
